(1)计税办法不同
一般纳税人按照销项税(即销售货物或增值税劳务，销售额×税率，税率为17%或者其他)一 进项税(即购买货物或增值税劳务并取得增值税专用发票上的税金)计算纳税；
小规模纳税人按照，销售额×征收率(征收率为3%)计算纳税；
(2)开票不同
一般纳税人可购买增值税专用发票并可自行向购货方开具，开票销项税率为17%或11%、6%。小规模纳税人不可以购买增值税专用发票自行向购货方开具，如需向购货方开具的，报税务机关申请代开，销项税率为3%；特殊行业可自行开具专用发票。(住宿业，建筑业，咨询鉴证)；小规模纳税人允许自行开具普通发票，不允许代开普通发票。
(3)申报不同
一般纳税人申报表：(1)2013增值税纳税申报表附列资料(一) （2）增值税纳税申报表附列资料（五） （3）2013增值税纳税申报表附列资料（二） （4）固定资产（不含不动产）进项税额抵扣情况表（5）本期抵扣进项税额结构明细表 （6）2013增值税纳税申报表附列资料（四） （7）增值税减免税申报明细表 （8）增值税纳税申报表(一般纳税人适用)
增值税一般纳税人纳税申报表为月报。
小规模纳税申报表：（1）小规模纳税人申报本期收入分类情况。（2）增值税减免税申报明细表(3)增值税纳税申报表(小规模纳税人适用)，小规模大部分是季报。
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